Fosforîlasyon bi pêşvebirina girêdana hîston H2A bi kromatînê re rêkxerê mezinbûna sereke DELLA di Arabidopsis de çalak dike.

Proteînên DELLA masterê parastî nerêkxerên mezinbûnêku roleke navendî di kontrolkirina pêşveçûna nebatan de di bersiva nîşanên navxweyî û jîngehê de dilîzin. DELLA wekî rêkxerê transkrîpsiyonê tevdigere û bi girêdana faktorên transkrîpsiyonê (TF) û hîston H2A bi rêya domaina GRAS-a xwe ji bo hedefgirtina pêşvebiran tê vexwendin. Lêkolînên dawî nîşan dane ku aramiya DELLA piştî wergerandinê bi du mekanîzmayan ve tê rêvebirin: polîubîkwîtînasyon ji hêla fîtohormona gibberellin ve tê çalak kirin, ku dibe sedema hilweşîna wê ya bilez, û konjugasyona guherînerên piçûk ên mîna ubîkwîtîn (SUMO) ji bo zêdekirina kombûna wê. Wekî din, çalakiya DELLA bi dînamîk ji hêla du glîkozîlasyonên cûda ve tê rêvebirin: têkiliya DELLA-TF ji hêla O-fukosîlasyonê ve tê zêdekirin lê ji hêla guherîna N-asetilglukozamîn a girêdayî O (O-GlcNAc) ve tê asteng kirin. Lêbelê, rola fosforîlasyona DELLA ne diyar e, ji ber ku lêkolînên berê encamên nakok nîşan dane, ji yên ku nîşan didin ku fosforîlasyon hilweşîna DELLA pêş dixe an kêm dike heya yên din ên ku nîşan didin ku fosforîlasyon bandorê li aramiya wê nake. Li vir, em cihên fosforîlasyonê di REPRESSOR de nas dikin.ga1-3(RGA, AtDELLA) ji Arabidopsis thaliana bi analîza spektrometriya girseyî hatine paqijkirin û nîşan didin ku fosforîlasyona du peptîdên RGA li herêmên PolyS û PolyS/T girêdana H2A û çalakiya RGA zêde dike. Têkiliya RGA bi pêşvebirên hedef re. Bi taybetî, fosforîlasyon bandorê li têkiliyên RGA-TF an jî aramiya RGA nake. Lêkolîna me mekanîzmaya molekulî ya ku fosforîlasyon bi rêya wê çalakiya DELLA teşwîq dike eşkere dike.
Ji bo zelalkirina rola fosforîlasyonê di rêkxistina fonksiyona DELLA de, girîng e ku cihên fosforîlasyona DELLA di vivo de werin destnîşankirin û analîzên fonksiyonel di nebatan de werin kirin. Bi paqijkirina afînîteyê ya ekstraktên nebatan û dûv re analîza MS/MS, me çend fosfosît di RGA de destnîşan kirin. Di bin şert û mercên kêmasiya GA de, fosforîlasyona RHA zêde dibe, lê fosforîlasyon bandorê li ser aramiya wê nake. Ya girîng, ceribandinên co-IP û ChIP-qPCR eşkere kirin ku fosforîlasyon li herêma PolyS/T ya RGA têkiliya wê bi H2A û têkiliya wê bi pêşvebirên hedef re pêş dixe, û mekanîzmaya ku fosforîlasyon bi wê fonksiyona RGA çalak dike eşkere dike.
RGA bi rêya têkiliya jêr-domaina LHR1 bi TF re ji bo kromatîna hedef tê kişandin û dûv re bi rêya herêma xwe ya PolyS/T û jêr-domaina PFYRE bi H2A ve girêdide, kompleksa H2A-RGA-TF çêdike da ku RGA-yê stabîl bike. Fosforîlasyona Pep 2 di herêma PolyS/T de di navbera domaina DELLA û domaina GRAS de ji hêla kînazek nenas ve girêdana RGA-H2A zêde dike. Proteîna mutant a rgam2A fosforîlasyona RGA betal dike û konformasyonek proteînek cûda digire da ku bi girêdana H2A re mudaxele bike. Ev dibe sedema bêîstîqrarbûna têkiliyên demkî yên TF-rgam2A û veqetandina rgam2A ji kromatîna hedef. Ev wêne tenê tepeserkirina transkrîpsiyonê ya bi navbeynkariya RGA nîşan dide. Şêweyekî wisa dikare ji bo çalakkirina transkrîpsiyonê ya bi navbeynkariya RGA were vegotin, ji bilî ku kompleksa H2A-RGA-TF dê transkrîpsiyona gena hedef pêşve bibe û defosforîlasyona rgam2A dê transkrîpsiyonê kêm bike. Wêne ji Huang et al.21 hatîye guhertin.
Hemû daneyên hejmarî bi karanîna Excelê ji hêla îstatîstîkî ve hatin analîzkirin, û cudahîyên girîng bi karanîna testa t ya Xwendekar hatin destnîşankirin. Ji bo destnîşankirina pêşwext a mezinahiya nimûneyê tu rêbazên îstatîstîkî nehatin bikar anîn. Ti dane ji analîzê nehatin derxistin; ceribandin bi awayekî rasthatî nehat hilbijartin; lêkolîner di dema ceribandinê û nirxandina encaman de ji belavbûna daneyan kor nebûn. Mezinahiya nimûneyê di destana wêneyê û pelê daneyên çavkaniyê de tê destnîşan kirin.
Ji bo bêtir agahdarî li ser sêwirana lêkolînê, li Kurteya Rapora Portfoliyoya Xwezayî ya bi vê gotarê ve girêdayî binêrin.
Daneyên proteomîk ên spektrometriya girseyî bi rêya depoya hevkarê PRIDE66 bi nasnameya daneyê PXD046004 ji konsorsiyûma ProteomeXchange re hatine şandin. Hemû daneyên din ên ku di vê lêkolînê de hatine bidestxistin di Agahiyên Pêvek, Pelên Daneyên Pêvek, û Pelên Daneyên Xav de têne pêşkêş kirin. Daneyên çavkaniyê ji bo vê gotarê hatine peyda kirin.